1、随着一周目的结束，主角也就会到了自己家，但这正意味着新的旅途的开始。
2、下楼后，会出现2个妈妈。她们会说起你碰到了2只传说中PM的事情。下面一个妈妈脱掉伪装露出了自己的真面目，原来他是神奥的国际**Handsome(汉森)。他会赞扬主角和馆主的活跃，使等离子团的城堡毁灭了，部下散的散逃的逃。
但是七贤者依然潜伏在伊修大陆的各个地方，所以冠军推荐你参与汉森的调查。
同意协助他调查，得到**钓竿。Handsome介绍钓竿用法后离开。
3、随即你就要去寻找六位贤者。出门后遇到两位劲敌。于是乎图鉴升级升级图鉴之后，基本只剩下支线剧情。来到第四个道馆的城镇，有很多设施的那个(精灵中心上面的左边一座民宅一楼左边的人可以拿秘传04怪力)，往右走过一段路到一座桥上，会遇到三个瞬移男，他们会给你金刚石，白玉，白金玉之后瞬移离开。
4、继续走会遇到一个研究所，该研究所是与前作联动的捕获地点，之后，研究院看见你身上有所有的勋章，然后惊讶了一番，便请你使用机器(DP，PT，HGSS)的PM传送过来，但是PM身上不能携带道具。
5、往右走过一座城市直接往右上出去，然后往上，在去新城市的门口找左边度假的少女谈话拿到秘传机器06潜水!在深的地方可以潜水，但只能去海底遗迹。海底遗迹在该城市右边海域，在上面的房子里可以遇到前作的冠军希罗娜，选是展开对战!
火神虫。火神虫种族值555，特攻135，速度100，算是本代亚神了，而且火+虫，打击面也不错。推荐配招虫鸣+热风or大火字+蝶之舞+暴风or精神干扰！（ps火神虫59级学会蝶之舞，60级热风，70级虫鸣，90级暴风，100级火焰之舞！）
三头龙。本代准神！种族值600，物攻105，特攻125，速度98，历代准神中**偏特攻的。推荐配招振奋+龙之波动+恶之波动+热风or冲浪。
班吉拉前，前代准神，班吉拉在15号道路有几率捕获，班吉拉物攻134，可惜速度只有61，种族值600.推荐配招雷电拳or磨爪+冷冻拳+咬碎+地震or石刃。
快龙，同班吉拉，准神，可以在龙塔钓，也可以选择它们的退化形。快龙推荐配招雷电拳+冷冻拳or飞天or暴风+地震or石刃+逆鳞。
另外备选精灵有：路卡利欧，风速狗，流氓鳄，达摩狒狒，水晶灯火灵，**娜，双斧战龙
1、通关1周目后，我们回到一周目的世界；
2、然后飞到水静市；
3、往上走到魅影摩天楼；
4、与其对话，就会看到有6大地区。我们这时候就需要分别去挑战这6大地区中的所有人；
5、全部挑战完成，出来，就会遇到人，给你天界之笛子；
6、回到世界裂缝，就开启可以进去二周目了。
